Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms