Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms