Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUSD1Q6UWL2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms