Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC1Q6TDU7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms