Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GARNL3Q5VVW2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms