Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GKAP1Q5VSY0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GKAP1Q5VSY0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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