Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms