Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms