Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms