Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ESCO2Q56NI9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms