Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL22Q53GT1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms