Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms