Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms