Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms