Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A8Q2Y0W8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A8Q2Y0W8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms