Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms