Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT24Q2M2I5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms