Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms