Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK2Q16620 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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