Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC37Q16543 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms