Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNAPC1Q16533 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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SNAPC1Q16533 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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