Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDB1Q16531 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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