Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNHIT3Q15649 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms