Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF1AQ15573 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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