Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SS18Q15532 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SS18Q15532 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SS18Q15532 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SS18Q15532 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SS18Q15532 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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