Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDSNQ15517 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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