Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms