Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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