Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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