Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAM2Q15035 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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