Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms