Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLCA4Q14CN2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
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