Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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