Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms