Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms