Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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C1orf61Q13536 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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C1orf61Q13536 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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C1orf61Q13536 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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C1orf61Q13536 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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C1orf61Q13536 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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C1orf61Q13536 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
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C1orf61Q13536 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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C1orf61Q13536 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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