Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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