Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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