Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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