Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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TRAF1Q13077 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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TRAF1Q13077 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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TRAF1Q13077 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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TRAF1Q13077 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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TRAF1Q13077 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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