Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms