Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FOXI1Q12951 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FOXI1Q12951 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FOXI1Q12951 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXI1Q12951 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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