Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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FOXC1Q12948 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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FOXC1Q12948 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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FOXC1Q12948 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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FOXC1Q12948 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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FOXC1Q12948 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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