Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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CHD3Q12873 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CHD3Q12873 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CHD3Q12873 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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CHD3Q12873 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CHD3Q12873 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CHD3Q12873 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CHD3Q12873 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CHD3Q12873 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHD3Q12873 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms