Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms