Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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KCNH2Q12809 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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