Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms