Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms