Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms