Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms